Phòng trừ sâu hại bằng phương pháp cơ giới, vật lý là biện pháp được người dân sử dụng từ rất lâu trước đây, sau này có thêm các biện pháp sử dụng đèn hoặc bức xạ. Trong các di chỉ khảo cổ, người ta tìm thấy các biện pháp bảo quản nông sản và hạt giống từ hàng nghìn năm trước.
Biện pháp vật lý an toàn đối với môi trường và cây trồng, nhưng hiệu quả giới hạn và tiêu tốn rất nhiều sức người, thường chỉ áp dụng nhiều trong bảo quản hoặc giai đoạn sâu hại mới xuất hiện.
Dùng sức người
Bắt sâu, ngắt bỏ ổ trứng sâu bằng tay, cắt tỉa những cành cây bị sâu đục, thu gom tàn dư cành, nhánh, trái bị sâu đục đem chôn tránh lây lan.
Biện pháp này rất hiệu quả, hạn chế được sâu bệnh phát triển. Ví dụ trên lúa dùng chà tre chảy lá khi bị sâu cuốn lá (giai đoạn lúa chưa trổ), dùng lưới kéo sâu keo, sâu phao, dùng vợt để bắt ốc bươu vàng…
Dùng ánh sáng
Đa số côn trùng trưởng thành của nhiều loại sâu hại thích ánh sáng đèn, lợi dụng vào đặc tính này của côn trùng người ta đặt bẫy đèn để diệt chúng. Qua thực nghiệm cho thấy ánh sáng đèn dầu, đèn điện đều thu hút được côn trùng vào đèn. Nhưng ánh sáng đèn hơi thủy ngân và nhất là ánh sáng đèn tia tử ngoại thu hút côn trùng nhiều hơn so với ánh sáng của các loại đèn khác do bước sóng tia tử ngoại ngắn nên hấp dẫn côn trùng mạnh hơn.
Dùng các bả độc
Mỗi loại côn trùng thích một mùi vị riêng nhất là loại bướm đêm, dựa vào đặc tính này của côn trùng người ta đặt bả độc để tiêu diệt chúng.
Ví dụ: diệt bướm sâu keo, sâu cuốn lá lớn, sâu cắn chẻn và sâu đất người ta đặt bẫy chua ngọt (4 phần mật đường + 4 phần giấm + 1 phần rượu + 1 phần nước). Bẫy đặt cao cách mặt đất 1 – 1,5m, có nấp đậy để giữ mùi, chỉ mở nấp vào ban đêm, mỗi hecta đặt 4 – 5 bẫy.
Dùng nhiệt độ
Biện pháp này chủ yếu được áp dụng trong kho chứa nông sản, để diệt mọt thóc đỏ người ta xử lý nhiệt độ trong kho chứa từ 48 – 52 độ C, trong thời gian từ 10 – 12 giờ. Hoặc sấy khô nông sản ở nhiệt độ 63 độ C để diệt hầu hết các loại mọt trong kho chứa.
Dùng độ ẩm
Sấy khô nông sản ở ẩm độ 13% hầu hết các loại côn trùng không gây hại được, hoặc người ta đặt chất hút ẩm trong nông sản cũng làm giảm bớt sự thiệt hại do côn trùng gây ra.
Biện pháp này sử dụng trong bảo quản nông sản hoặc hạt giống.
Dùng tia X và Y
Người ta dùng tia X để diệt côn trùng với cường độ 5.000 rơgen diệt một số loại mọt ăn da, mọt gỗ. Với cường độ 8.000 rơgen diệt hầu hết các loại mọt trong nông sản.